Postdoc i de molekylære mekanismer og evolution af svampe-antimikrobiel resistens - DTU Bioengineering

Hvis du brænder for bæredygtighed og er interesseret i svampebiologi og genetik, så overvej at blive en del af vores team som postdoktoral forsker. Plantepatogene svampe udvikler i stigende grad resistens over for flere forskellige klasser af fungicider. Dette resulterer i betydeligt tab af fødevareproduktion og forringer effektiviteten af fungicidstyringspraksis.

Endvidere er dette ikke blot en bekymring for landbrugsfødevareproduktion, men også for menneskers helbred, da overførsel af resistens mellem landbrugsmiljøer og medicinske miljøer bliver forværret af klimaforandringer og multi-værts patogene svampe, der inficerer både planter og mennesker. I dette projekt vil du anvende eksperimentel evolution og genom-re-sekventering for at undersøge hvordan resistens mod fungicider udvikler sig, særligt med fokus på resistens uden målet og polygenisk tilpasning til fungicider.

Ansvarsområder og kvalifikationer

Postdoktorforskeren vil lede de eksperimentelle evolutionsindsatser for at undersøge soppens antimikrobielle resistens. Dine kerneansvarsområder vil inkludere:

• Laboratorieeksperimentel evolution: Brug af grundlæggende mykologi-laboratorieteknikker til in-vitro kultur til at udføre eksperimentel evolution af filamentøse patogene svampe. Du vil seriell-videreudvikle svampe i forskellige in-vitro miljøer og stressfaktorer.
• Svampefænotypeanalyse: Du vil bruge state-of-the-art svampevækstfænotypering ved brug af høj gennemløbsmikroskopisk billeddannelse og automatiseret AI-assisteret billedanalyse til at vurdere eksperimentelt udviklede stammer.
• Genomik og transkriptomik: Anvend helgenomsekventering og transkriptomik-analyse, startende med DNA/RNA-ekstraktion og sekventering samt bioinformaticianalyse involverende genom-assembelskning, gene annotation og transkriptomisk analyse ved brug af RNA-seq-metodologi.
• Videnskabelig kommunikation: Vær med til at udarbejde manuskripter til højtoriske, fagfællebedømte tidsskrifter og præsentere dine resultater ved internationale konferencer.
• Mentorskab: Giv vejledning og teknisk mentorskab til ph.d., MSc og BSc-studerende og praktikant i gruppen.

Kvalifikationer

• Dokumenteret erfaring med arbejde med filamentøse svampe i laboratoriet
• Hands-on erfaring med molekylær laboratorieteknikker anvendt til studiet af molekylærbiologi af filamentøse svampe, herunder ekstraktion af højmolekylært DNA/RNA fra filamentøse svampe egnet til lang-læsning-sekventering og genredigeringsmetoder som CRISPR-Cas9.
• Erfaring med kommandolinjebaseret bioinformatikanalyse af rå sekvensdata, genom-assemblering og genannotation, samt standard RNA-seq-baserede transkriptomiske pipelines.
• Høj kompetence i standard programmeringssprog brugt i bioinformatik (f.eks. Python og/eller R) og kendskab til arbejde på store computerservere.
• Et stærkt historik af videnskabeligt output, demonstreret ved førsteforfatter-publicationer i fagfællebedømte tidsskrifter.
• Undtagelige skriftlige og mundtlige kommunikationsevner på engelsk, med evnen til at formidle komplekse begreber til tverrfaglige målgrupper, især eksperimentelle forskere.
• Direkte erfaring med vejledning af praktikanter på BSc-, MSc- og PhD-niveau i mykologi og svampegenomik.

Som formel kvalifikation skal du have en PhD-grad (eller tilsvarende).

Vi tilbyder

DTU er et førende teknisk universitet globalt anerkendt for fremragende forskning, uddannelse, innovation og videnskabelig rådgivning. Vi tilbyder et givende og udfordrende job i et internationalt miljø. Vi stræber efter akademisk ekspertise i et miljø præget af kollegial respekt og akademisk frihed under ansvar.

Løn- og ansættelsesvilkår

Ansættelsen vil være baseret på overenskomst med Finansforeningen. Derudover kan tillæg forhandles i overensstemmelse med DTUs lønstruktur for videnskabeligt personale: www.inside.dtu.dk/en/human-resources/during-employment/salary/salary-structures.

Ansættelsesperioden er 2,5 år (30 måneder) med målstart 1. januar 2027 (eller efter gensidig aftale). Stillingen er en fuldtidsstilling.

Du kan læse mere om karriereveje på DTU her .

Yderligere information

Yderligere oplysninger kan fås hos adjunkt Henrik H. De Fine Licht, Sektion for Synthetic Biology, DTU Bioengineering, [email protected]

Du kan læse mere om DTU Bioengineering på DTU Bioengineering.

Hvis du søger fra udlandet, kan du finde nyttige oplysninger om at arbejde i Danmark og ved DTU på DTU – Moving to Denmark.

Ansøgningsprocedure

Din komplette onlineansøgning skal indsendes senest 23. oktober 2026 (23:59 dansk tid) .

Ansøgninger skal indsendes som én PDF-fil indeholdende alle materialer, der skal tages i betragtning. For at ansøge, åbn venligst linket "Apply now", udfyld online ansøgningsskemaet og vedhæft alle dine materialer på engelsk i én PDF-fil . Filen skal indeholde:

• Ansøgning (dækbrev) – der angiver hvorfor du søger stillingen
• CV
• Akademiske diplomer (MSc/PhD – på engelsk)
• Oversigt over publikationer

Ansøgninger modtaget efter fristen vil ikke blive vurderet.

Alle interesserede kandidater uanset alder, køn, handicap, race, religion eller etnisk baggrund opfordres til at søge. Da DTU arbejder med forskning i kritisk teknologi, som er underlagt særlige regler om sikkerhed og eksportkontrol, kan åbne baggrundstjek kan blive udført på kvalificerede kandidater til stillingen.

Fungal Interactions Group i Sektionen for Synthetic Biology ved DTU Bioengineering har til formål at forstå mekanismerne for svampeinteraktioner med plante- og husdyrværter for at konstruere og udvikle nye måder at anvende gavnlige svampe og bekæmpe skadelige svampe i landbrug og bioteknologiske industrier. Vi bruger en blanding af beregningsmæssige og eksperimentelle laboratorie- og feltmetoder i vores arbejde.

Institut for Bioteknologi og Biomedicin (DTU Bioengineering) er en international førende aktør inden for bioteknologi og biomedicin. Vores ingeniørmæssige tilgang til alle aspekter af bioteknologi og biomedicin placerer os som en værdifuld aktør med unikke kompetencer i en voksende bio-baseret økonomi og i sundhedssystemer, der transformerer sig mod personlig medicin.

Vi har et klart fokus på behovene i life science- og biotech-industrierne og peger mod innovation, nye forretninger og videnskabelige tjenester til gavn for samfundet. Instituttet har omfattende samarbejde med nationale og internationale forskningsenheder og industrien. DTU Bioengineering har ca. 400 ansatte, hvoraf 2/3 er forsknings-personale. Instituttet ligger på DTU Lyngby Campus.

DTU – Til gavn for samfundet siden 1829

DTU er et af Europas førende elite tekniske universiteter. Gennem forskning og uddannelse på internationalt topniveau skaber vi løsninger på samfundets store udfordringer i vores tid og hjælper med at sikre Europas globale førerposition inden for bæredygtig teknologisk udvikling. Siden Hans Christian Ørsted grundlagde DTU for næsten 200 år siden, har vores mission været den samme: Vi udvikler og skaber værdi gennem natur- og tekniske videnskaber til gavn for samfundet.

DTU har 13.800 studerende, 1.600 ph.d.-studerende og 6.500 medarbejdere. Vi arbejder i et internationalt miljø og har en inkluderende, stimulerende og uformel arbejdskultur. DTU har campusser i alle dele af Danmark og i Grønland og samarbejder med de bedste universiteter verden over.

Sted

Kgs. Lyngby, Danmark

Ansøg inden

2026-10-23T21:59:00+00:00