Postdoktor i proteiningeniørkunst og rumlig glycobiologi af mikrobielle biofilm

Kunne du tænke dig at udvikle nye fluorescerende værktøjer til at visualisere de sukkerpolymere, der holder mikrobielle biofilmer sammen? Vi søger en nysgerrig og samarbejdsvillig postdoktoral forsker til at udvikle en ny generation af molekylære sonder og bruge dem til at studere komplekse mikrobielle samfund.

Ved Fakultetet for Ingeniørvidenskab og Naturvidenskab,Afdelingen for Kemi og Bioscience, Aalborg Universitet, er en fuldtids postdoc-stilling baseret i Aalborg, Danmark, ledig til tiltrædelse fra 1. februar 2027 eller så hurtigt som muligt herefter. Stillingen er på 35 måneder med forventet slutførsel den 31. december 2029 og er knyttet til GlycoProbe-projektet (Catalytisk inaktive glykan-prober til løsning af eksopolysakkarider i komplekse mikrobielle samfund).

Dine arbejdsopgaver

Din primære ansvar vil være at udvikle og validere fluorescerende molekylære sonder baseret på katalytisk inaktive glykanaser. Disse enzymer vil blive konstrueret til at bevare deres selektive binding til specifikke eksopolysakkarider, mens deres kinetiske aktivitet mistes. Dit arbejde vil omfatte molekylær kloning, rekombinant proteinsudtryk og rensning, struktur-infoerede protein engineering, sted-specifik mutagenese og fluorescerende labeling.

Du vil evaluere sonderes specificitet og bindingsegenskaber ved hjælp af rensede reference-polysakkarider og definerede mikrobielle kulturer samt optimere sonderne til fluorescensbillede.

I samarbejde med kolleger inden for mikrobiologi og bioinformatik vil du identificere miljørelevante glykanaser forbundet med eksopolysakkarideproduktion og -nedbrydning i komplekse mikrobielle samfund. Dette arbejde vil kombinere genom-resolveret microbiom-analyse, berigelseskulturer og transkriptomiske tilgange for at identificere lovende kandidat-enzymer, som senere vil blive indarbejdet i sonderudviklings- og valideringspipeline.

Du vil også anvende de udviklede sonder til at undersøge den rumlige organisering af eksopolysakkarider i aktiverede slamflokker, granuler og mikrobielle biofilmer. Ved at kombinere fluorescensmikroskopi med fluorescence in situ-hybridisering (FISH) vil du undersøge forholdet mellem eksopolysakkaridfordeling, mikrobiel identitet og samfundsstruktur. Stillingen omfatter også eksperimentel planlægning, dataanalyse, udarbejdelse af videnskabelige publikationer og samarbejde med forskere ved Aalborg Universitet og professor Jochen Schmid ved Universitetet i Münster.

Dine kompetencer

Søgende skal have en ph.d. i biokemi, strukturel biologi, molekylærbiologi, bioteknologi eller et tæt relateret område. Dokumenteret praktisk erfaring med molekylær kloning, rekombinant proteinsudtryk og rensning samt proteinengineering er væsentlig. En stærk forståelse for protein struktur-funktion forhold er særligt vigtigt.

Erfaring med sted-specifik mutagenese, kulhydrataktive enzymer, biokemiske bindingsassays eller fluorescerende protein-labeling er yderst ønskelig. Erfaring inden for mikrobiologi, bioinformatik, metagenomik og transkriptomik vil være en fordel.

Kvalifikationskrav

Tiltrædelse som postdoc kræver akademiske kvalifikationer på PhD-niveau.

Hvem vi er

Ved afdelingen for Kemi og Bioscience (BIO) spænder vores forskningsaktiviteter fra basis til anvendt inden for både naturvidenskab og ingeniørvidenskab. Med ca. 200 ansatte, 75 ph.d.-studerende og 775 bachelor- og kandidatstuderende på vores campusser i Aalborg (hovedcampus) og Esbjerg, er vi en vital forsknings- og uddannelsesinstitution, når det gælder at skabe ny grundviden samt bidrage til at løse verdens udfordringer inden for biologi, kemi, bioteknologi, bioingeniørvidenskab, miljøvidenskab og kemisk engineering.

Postdoc-stillingen vil tilslutte sig forskningsgruppen Microbial Ecology and Biofilms ved Center for Microbial Communities, ledet af lektor Morten Kam Dahl Dueholm. Projektet kombinerer proteinengineering, molekylær mikrobiologi, genom-resolveret analyse og rumlig billeddannelse, med adgang til relevante forskningsfaciliteter og international ekspertise.

Vi arbejder løbende på at forbedre vores afdeling som et attraktivt arbejds- og studiemiljø. Vi tilbyder fleksible arbejdstider, sociale aktiviteter hele året både på afdelingsniveau og i hver sektion. Vi er inkluderende og viser respekt for enkeltpersoner, fællesskaber og kulturer. Vores arbejdsrammer er baseret på åbenhed, nysgerrighed, gennemsigtighed og inddragelse. Kom og bidrag!

Læs mere om afdelingen her; Velkommen til Afdelingen for Kemi og Bioscience - en.bio.aau.dk - Aalborg Universitet

Sådan ansøger du

Din ansøgning skal indeholde følgende

• Ansøgning, der angiver grunde til ansøgningen, kvalifikationer i relation til stillingen og intentioner og visioner for stillingen
• Curriculum Vitae (CV)
• Examen/gradspapirer (master og PhD)
• Publikationsliste med angivelse af de vedlagte publikationer, som du ønsker taget i betragtning i vurderingen. Du må vedlægge maksimalt fem publikationer.
• Dokumentation for undervisningskompetencer, hvis relevant.
• Formidlingserfaring, herunder deltagelse i udvalg eller bestyrelser, deltagelse i organisationer osv.
• Yderligere kvalifikationer i relation til stillingen
• Referencer/anbefalinger

Du kan læse mere om kravene til din ansøgning her .

Ansøgningen skal indsendes via Aalborg Universitets rekrutteringssystem, som kan tilgås under stillingsannoncen på Aalborg Universitets hjemmeside.

Aalborg Universitet ønsker at afspejle det omkringliggende samfund og har mangfoldighed som en kerneværdi. Derfor opfordres alle, uanset personlig baggrund og orientering, til at søge stillingen.

Aalborg Universitet har en politik om sideordnet sprogbrug. Internationale medarbejdere opfordres, med støtte fra universitetet, til at lære dansk under deres ansættelse for at støtte deres integration i arbejdspladsen og i det danske samfund.

Danske sprogkurser vil blive tilbudt som en del af ansættelsen.

Har du spørgsmål?

Hvis du har spørgsmål vedrørende stillingen, er du mere end velkommen til at kontakte os. Du vil finde kontaktpersoner for enden af jobopslaget.

Yderligere information

Læs mere om vores rekrutteringsproces her

Tilsettingsprocessen ved Aalborg Universitet involverer en udvælgelsesproces. Du kan læse mere om udvælgelse og ansættelsesprocessen her .

Ansættelsesprocessen ved Aalborg Universitet kan indeholde en risikovurdering som et værktøj til at identificere potentielle risici forbundet med nyansatte, for at sikre arbejdsmiljøets sikkerhed, overholdelse og integritet.

Løn og ansættelsesvilkår

Stillingen er i overensstemmelse med Ministerialordningen om ansættelse af videnskabeligt personale ved universiteterne og ministerialordningen om stillingsstruktur for videnskabeligt personale ved universiteterne. Desuden er dine ansættelsesvilkår og løn i overensstemmelse med overenskomsten mellem Akademikernes Centralorganisation og staten (AC-overenskomst) og protokol om visse vilkår for ansættelse af videnskabeligt personale ved universiteterne.

Du kan finde information om lønnen og lønstrukturen for stillingen i Lønoversigt for rekruttering - Videnskabelige stillinger (VIP) . Henvis venligst til indledningen på siden og afsnittet med overskriften “Postdoc”.

Aalborg Universitet - Knowledge for the world

Aalborg Universitet er en international arbejdsplads med mere end 3.700 ansatte. Vi tilbyder arbejde med virkelighedsnære uddannelser og skaber forskning i verdensklasse gennem samarbejde mellem forskere, studerende og offentlige og private virksomheder. Det er sådan, vi opnår indsigter, nye løsninger på samfundsmæssige problemer og viden, der forandrer verden. Vores hovedcampus ligger i Aalborg, men vi har også campusser i Esbjerg og København.