Postdoktor i mikrobiell enkeltcellegenomik og transkriptomik

Vi indkalder ansøgninger til en fuldtids postdoktorstilling på 24 måneder i forskningsgruppen Social Systems Microbiology ved Sektionen for Mikrobiologi, Institut for Biologi, Københavns Universitet.

Projektets fokus vil være på enkeltcelle-transkriptomik og genomik af prokaryoter og på at optimere protokoller til at erhverve ekstrakromosomale elementer og deres transkripter.

Projektet, som postdocen vil arbejde på, er motiveret af en forståelse af fenotypisk heterogenitet i mikroorganismer: hvordan og hvorfor genetisk identiske celler danner forskellige fenotypiske underpopulationer, og hvilke mekanismer der giver anledning til denne mangfoldighed. Du vil blive en del af et udforskende, metodefokuseret projekt i dette område, finansieret af Villumfonden. Arbejdet kombinerer wet-lab-metodeudvikling med sequencing og dataanalyse på tværs af en række bakterier og arkæer.

Projektet er grundforskning og åben endelig i design, og du vil have betydelig frihed til at forme, hvordan metoder udvikles og anvendes. Derfor søger vi en nysgerrig, engageret og kreativ forsker, der motiveres af både metodeudvikling og opdagelse.

Dine opgaver

• Dyrk og arbejd med et alsidigt udvalg af bakterier og arkæer
• Udvikle og optimere protokoller til isolering og sekventering af ekstrakromosomalt DNA og tilhørende transkripter fra bakterier og arkæer
• Anvend og tilpas enkeltcelle-transkriptomiske og genomiske tilgange til prokaryoter
• Kvantisér DNA og RNA ved hjælp af qPCR og digital PCR, og udfør bulk DNA- og RNA-sekventering
• Analysér sekventeringsdata, publicer resultater og bidrag til gruppens videnskabelige miljø

Din profil

• PhD i mikrobiologi, mikrobiel bioteknologi, molekylærbiologi eller et relateret felt
• Praktisk erfaring med molekylære metoder og forberedelse af DNA- og/eller RNA-sekvenseringsbiblioteker
• Grundlæggende bioinformatiske færdigheder til analyse af sekventeringsdata (f.eks. i R eller Python)
• Kan arbejde selvstændigt samtidig med at samarbejde godt i et team
• Fremragende skriftlig og mundtlig engelsk
• Erfaring med prokaryotiske enkeltcelle-omikmetoder er en stor fordel
• Erfaring med metodedvelopment, fejlfinding og tilpasning af protokoller er en stor fordel
• Erfaring med at dyrke forskellige bakterier og/eller arkæer er en fordel

Vi tilbyder

En international og samarbejdsorienteret forskningsgruppe, der studerer molekylær biologi, økologi og evolution af bakterieinteraktioner, integreret i Sektionen for Mikrobiologi med adgang til topmoderne faciliteter og et særligt fokus på et godt arbejdsmiljø. Vi værdsætter ambitiøs videnskab ligeså meget som et venligt, teamorienteret arbejdsmiljø.

Du vil komme til at tilhøre

• Et støttende, internationalt team hvor idéer deles åbenlyst
• Et stærkt netværk af internationale og nationale samarbejdspartnere inden for og uden for mikrobiologi
• Et aktivt socialt miljø med en kultur for at hjælpe hinanden med at få succes
• En ramme der opfordrer dig til at udvikle dine egne forskningsidéer

Postdocens pligter omfatter forskning inden for Mikrobiell Enkeltcelle-Genomik og Transkriptomik samt undervisning. Stillingen kan også omfatte udførelse af andre opgaver.

Yderligere information om Instituttet findes på https://www1.bio.ku.dk. Henvendelser vedrørende stillingen kan rettes til adjunktprofessor Jonas Stenløkke Madsen ([email protected]).

Stillingen er ledig fra den 01-02-2027 eller så hurtigt som muligt derefter.

Universitetet ønsker, at vores personale afspejler samfundets mangfoldighed, og derfor byder det velkomne ansøgninger fra alle kvalificerede kandidater uanset personlig baggrund.

Ansættelsesvilkår

Stillingen er omfattet af Memorandum om stillingsstruktur for akademisk personale.

Tiltrædelses- og lønvilkår følger aftalen mellem Finansministeriet og Akademikernes Centralorganisation i staten.

Forhandling om lønstillæg er mulig.

Du kan læse mere om lønniveauer i statslige sektor www.loenoverblik.dk (på dansk).

Ansøgningen, på engelsk, skal indsendes elektronisk ved at klikke nedenfor på APPLY NOW.

Inkludér venligst

• Et følgebrev (maks. 1 side)
• Curriculum vitae
• Diplomer (Master- og PhD-grad eller tilsvarende)
• Fuldt publikationliste

Ansøgningsfristen er 19-11-2026 kl. 23:59 GMT +1 .

Efter ansøgningsfristens udløb udvælger den autoriserede rekrutteringsansvarlige ansøgere til vurdering efter råd fra Interviewkomitéen.

Du kan læse om rekrutteringsprocessen på http://employment.ku.dk/faculty/recruitment-process/ .

Interviews afholdes i uge 50-51