Sequencing Platform and Service Manager ved Sektionen for Mikrobiologi

Biologiafdelingen ved Det Naturvidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet søger en sequencing platform og service manager med virkning fra 1. december 2026.

Om os

Ved Sektionen for Mikrobiologi arbejder vi på at forstå og udnytte den enorme funktionelle mangfoldighed og tilpasningsevne i naturlige mikrobiom-samfund ved hjælp af banebrydende molekylære teknikker herunder højgennemløbs DNA-sekventering, celleudvælgelse, enkeltcelle-detektion og realtids biofilmdannelse ved Bioflux-centret.

Opgaver

Stillingen er til koordinering af sekventeringsdriften og laboratoriearbejdsprocesser i en bredere rolle, der kombinerer service management, metodeudvikling, datahåndtering, kundekoordination, teknisk rådgivning og platformadministration.

Dine opgaver vil omfatte

• Håndtering af sekventeringstjeneste- kontrakter, inklusive koordinering med interne og eksterne interessenter og opfølgning på servicelevering.
• Fungere som hovedkontaktperson for leverandører af sekventeringsplatforme og koordinere tekniske og operationelle forhold relateret til platformene.
• Udvikle og implementere nye analytiske protokoller, herunder arbejdsflow for 16S-sekventering og analyse ved brug af PacBio.
• Påtage sig ansvaret for lagring, organisering, håndtering og tilgængelighed af sekventeringsdata.
• Udføre og overvåge data-rengøring og forberedelse som led i sekventerings- og analyseworkflow.
• Fungere som direkte kontakt for eksterne kunder og samarbejdspartnere, herunder koordinering af sekventeringsforespørgsler, krav, tidsplaner og tekniske spørgsmål.
• Udvikle, opdatere og give vejledning om laboratorie- og sekventeringsprotokoller for at sikre ensartede procedurer og kvalitet.
• Give teknisk rådgivning til brugere af tjenesten og kolleger om DNA-relaterede teknikker, prøveforberedelse, sekventeringskrav og fejlfinding.

Vi forventer

• En relevant kandidatuddannelse eller tilsvarende akademisk kvalifikation inden for f.eks. mikrobiologi, molekylærbiologi, bioteknologi, biokemi, bioinformatik eller et relateret felt.
• Praktisk erfaring med molekylærbiologi og DNA-baserede laboratoriemetoder, herunder DNA-ekstraktion, prøveforberedelse, PCR og sekventeringsarbejdsgange.
• Erfaring med next-generation sequencing-teknologier og fortrinsvis både korte- og lange læse-tilgange.
• Erfaring med eller kendskab til amplicon-sekventering, særligt 16S rRNA-gen-sekventering. Erfaring med PacBio-sekventering er en fordel.
• Erfaring med håndtering, kvalitetssikring, organisering og ledelse af sekventeringsdata.
• Erfaring med koordinering af tekniske ydelser, laboratoriearbejdsprocesser, forskningsinfrastruktur, platforme eller projekter.
• Evnen til at rådgive forskere og brugere om tekniske spørgsmål og oversætte videnskabelige krav til praktiske arbejdsflow.
• Gode IT- og datahåndteringsfærdigheder. Erfaring med bioinformatiske arbejdsflow eller analyse af sekventeringsdata er en fordel.
• Gode skriftlige og mundtlige kommunikationsevner på engelsk.

Vi tilbyder

Vi tilbyder en selvstændig og varieret stilling i et internationalt orienteret forskningsmiljø, hvor du vil få mulighed for direkte at bidrage til udvikling og drift af sekventeringstjenester og forskningsinfrastruktur.

Du vil arbejde tæt sammen med forskere, teknisk personale, studerende, eksterne samarbejdspartnere, brugere af tjenesten og teknologileverandører og vil få muligheder for at udvikle din ekspertise inden for sekventeringsteknologier, laboratorie- og analytiske arbejdsflow, datahåndtering og forvaltning af forskningsinfrastruktur.

Sektionen for Mikrobiologi tilbyder et samarbejdspræget arbejdsmiljø med adgang til avancerede teknologier og forskningsaktiviteter, der spænder over mikrobielfællenskaber, mikrobiomforskning, mikrobielle interaktioner, miljømikrobiologi og beslægtede områder.

Arbejdssted

Arbejdsstedet er Sektionen for Mikrobiologi, Department of Biology, Københavns Universitet. Vi tilbyder kreative og stimulerende arbejdsvilkår i et dynamisk og internationalt forskningsmiljø.

Løn- og ansættelsesvilkår

Stillingen er fuldtid med en gennemsnitlig arbejdstid på 37 timer om ugen. Stillingen er en tidsbegrænset stilling på 1 år. Startdatoen er 1. december 2026 eller efter aftale.

Ansættelsen vil være som Specialkonsulent efter Overenskomsten om akademikere i staten indgået mellem Skatteforvaltningen (Danish Ministry of Finance) og Akademikerne (de danske professional associations). Der vil være mulighed for forhandling af tillæg baseret på kvalifikationer. Du kan læse mere om lønrammer i staten via www.loenoverblik.dk (på dansk).

Din ansøgning

Hvis du har interesse i stillingen, bedes du indsende din elektroniske ansøgning, inklusive bilag, via UCPH Jobportal (klik på “APPLY NOW”-linket i bunden af jobopslaget).

Din ansøgning bør indeholde

• Ansøgning der adresserer kravene (maks. en side).
• Curriculum Vitae
• En attest/udskreven kopi af certifikat(er) for uddannelse

Ansøgningsfrist er den 22. oktober 2026.

Interviews afholdes i uge 43-44.

Københavns Universitet søger at afspejle samfundet og opfordrer til ansøgninger uanset personlig baggrund.

Yderligere spørgsmål

Eventuelle spørgsmål om stillingen kan rettes til professor Søren Johannes Sørensen, [email protected].

Københavns Universitet har etableret en ny fælles administrativ struktur, som stadig implementeres. Dette medfører igangværende ændringer og udvikling af blandt andet arbejdsgange og samarbejdsområder.

Københavns Universitet giver sine knap 10.000 medarbejdere muligheder for at udnytte deres talent fuldt ud i et ambitiøst, uformelt miljø. Vi sikrer traditionsrige og moderne rammer om uddannelser og fri forskning på højt internationalt niveau. Vi søger svar og løsninger på fælles problemer og gør ny viden tilgængelig og nyttig for andre.

Kontakt

Søren Johannes Sørensen

E-mail: [email protected]

Info

Ansøgningsfrist: 22-10-2026

Ansættelsesdato: 01-12-2026

Arbejdstid: Fuldtid

Afdeling/Sted: Department of Biology