Vidensingeniør - BRIGHT

Standarder og ontologier for data-drevet bioproduktion ved BRIGHT Biofoundry

Er du passioneret omkring at omdanne kompleks videnskabelig information til velstruktureret, genanvendelig viden? Vil du være med til at forme de data-standarder, der vil drive den næste generation af automatiseret bioproduktion? Vi leder efter en motiveret Knowledge Engineer til at blive en del af Standards Office i BRIGHTs Informatics Platform, hvor du vil arbejde i skæringspunktet mellem bioteknologi, data science og semantiske teknologier.

Hos BRIGHT bygger vores Informatics Platform den data- og softwareinfrastruktur, der binder BRIGHT Biofoundry, vores Mission-projekter og vores internationale partnere sammen. Standards Office sikrer, at data, vi genererer, er findbare, tilgængelige, interoperable og genanvendelige (FAIR) – fra de første projektkrav til maskin-handling data, som kan fodre automatiserede workflows og AI-modeller.

Du bliver en del af et tværfagligt og internationalt team, der arbejder tæt sammen med forskere, ingeniører og data scientists, og du får mulighed for at udvikle din ekspertise inden for ontologiarbejde og data standarder i et hurtigt skiftende og ambitiøst forskningsmiljø.

Jobbet

Som Knowledge Engineer vil du være forbindelsen mellem videnskabsmands data-behov og de fælles standarder, der gør data interoperable. Du vil arbejde tæt sammen med dine kolleger i Standards Office samt med Research Software Engineering- og Data Science-teams i Informatics Platform for at sikre, at standarder implementeres i praksis – i vores data-modeller, pipelines, værktøjer og laboratorie­systemer.

Dine hovedansvarsområder vil være at

• Oversætte standarder og data­krav fra BRIGHT Mission-projekter og globale partnerskaber til eksisterende fællesskabsstandarder, vokabularier, terminologier og ontologier
• Identificere huller, hvor eksisterende standarder ikke dækker vores behov, og foreslå og implementere udvidelser i samarbejde med relevante fællesskaber
• Fungere som forbindelse mellem Standards Office og Research Software Engineering- og Data Science-teams, og hjælpe med at oversætte semantiske modeller til dataschemas, metadata-skabeloner og softwareimplementeringer
• Fortsætte udviklingen og vedligeholdelsen af PREFER-ontologien (PREcision FERmentation) i samarbejde med nationale og internationale partnere, herunder frigivelser, dokumentation og tilpasning til andre fællesskabsontologier
• Engagere sig i bioproduktionsfællesskabet gennem workshops, arbejdsgrupper og open-source bidrag til at udvikle, tilpasse og vedtage standarder inden for feltet
• Bidrage til dokumentation, træningsmaterialer og retningslinjer, der hjælper forskere med at anvende standarder i deres daglige arbejde

Vores forventninger til dig

Du er nysgerrig, struktureret og lærenem, og du nyder at bringe orden i kompleks information. Vi forventer, at du har:

• En MSc-grad i bioinformatik, datalogi, informationsvidenskab, bioteknologi, life sciences eller et relevant felt
• Kendskab til, eller erfaring med, ontologier og semantiske web-teknologier (f.eks. OWL, RDF, SPARQL) og fortrolighed med fællesskabsressourcer som OBO Foundry og Basic Formal Ontology (BFO)
• Programmeringsfærdigheder, fortrinsvis i Python, og erfaring med versionsstyring (Git/GitHub)
• Forståelse af FAIR-principperne og interesse i data standarder og metadata
• Interesse i bioteknologi, bioprocesser eller bioproduktion

Det vil være en fordel, hvis du har erfaring med ontologiudviklingsværktøjer (f.eks. Protégé, ROBOT eller Ontology Development Kit), data-modelleringsrammer (f.eks. LinkML) eller har bidraget til open-source- eller fællesskabsstandardiseringsprojekter.

Som person er du en teampartner med gode kommunikationsevner, der nyder at samarbejde med mennesker fra forskellige videnskabelige baggrunde. Du formår at forklare tekniske begreber for ikke-specialister, du tager ejerskab over dine opgaver, og du kommunikerer flydende på engelsk, både mundtligt og skriftligt.

Hvad vi tilbyder i stedet

Vi tilbyder et interessant og udfordrende job i en international atmosfære med fokus på forskning, innovation og samarbejde med akademiske og industrielle partnere til gavn for det omkringliggende samfund. Du bliver en del af et nyetableret og ambitiøst forskningsinstitut, hvor du kan gøre en reel forskel i, hvordan bioproduktiondata beskrives og deles globalt.

Vi lægger vægt på et højt niveau af professionalisme blandt vores medarbejdere, så kompetenceudvikling er en integreret del af vores organisation. Du vil modtage støtte og vejledning fra erfarne kolleger, og du vil have mulighed for at deltage i fællesskabs-møder, workshops og konferencer. Vi tilbyder stor fleksibilitet i stillingen. Inden for området tekniske og naturvidenskabelige fag er DTU en af Europas førende forsknings- og uddannelsesinstitutioner.

Løn og ansættelsesvilkår

Ansættelsen vil være baseret på overenskomsten med Danske A-kasser (AC). Du ansættes som Academic Officer. Derudover kan tillæg forhandles i overensstemmelse med DTUs lønstruktur for akademiske medarbejdere ansat i teknisk-administrative stillinger ved DTU (AC TAP): https://www.inside.dtu.dk/en/human-resources/during-employment/salary/salary-structures.

Stillingen er en fuldtidsstilling. Startdato er 01.01.2027 (eller ifølge gensidig aftale). Arbejdsstedet er DTU Lyngby Campus.

Søgning og kontakt

Venligst indsende din online ansøgning senest søndag den 15. november 2026. Åbn linket “Apply now”, udfyld skemaet og vedhæft din motiverede ansøgning, CV og eksamensbeviser.

Du kan læse mere om BRIGHT på bright.dtu.dk.

Hvis du ønsker yderligere oplysninger om stillingen, venligst kontakt Alberto Santos Delgado, [email protected]

Ansøgninger indsendt efter fristen vil ikke blive behandlet.

Alle interesserede ansøgere uanset alder, køn, handicap, race, religion eller etnisk baggrund opfordres til at søge. Da DTU arbejder med forskning i kritiske teknologier, som er underlagt særlige regler for sikkerhed og eksportkontrol, kan åbne kildes baggrundschecks foretages af kvalificerede kandidater til stillingen.

Om BRIGHT – Novo Nordisk Fonden Teknologiforskning Institut for Grøn Omstilling

BRIGHT er et større initiativ baseret på DTU, der har til formål at fremskynde udviklingen af biosolutions og styrke bio-baserede økonomi. BRIGHT fungerer som et knudepunkt for akademiske og industrielle partnere, der arbejder sammen for at låse potentialet op for bioproduktion.

BRIGHT fokuserer på tre hovedområder: Bæredygtige materialer (udvikling af biobaserede alternativer til fossilderiveret materiale), Mikrobielle fødevarer (innovativ fødevareproduktion gennem mikrobielle teknologier) og Mikroorganismer til net-zero landbrug (udvikling af løsninger til at reducere drivhusgasemissioner i landbruget).

Målet er at udvikle og skalere innovative biosolutions inden for disse områder, hvilket i sidste ende skaber bæredygtige og konkurrencedygtige alternativer til fossilderede produkter og processer, der kan bidrage betydeligt til at reducere globale drivhusgasemissioner.

DTU – Til gavn for samfundet siden 1829

DTU er et af Europas førende elite-tekniske universiteter. Gennem forskning og uddannelse på internationalt topniveau skaber vi løsninger på samfundets store udfordringer og hjælper med at sikre Europas globale førerposition inden for bæredygtig teknologisk udvikling. Siden Hans Christian Ørsted grundlagde DTU for næsten 200 år siden, har vores mission været den samme: Vi udvikler og skaber værdi gennem naturvidenskaberne og tekniske videnskaber til samfundets gavn.

DTU har 13.800 studerende, 1.600 PhD-studerende og 6.500 medarbejdere. Vi arbejder i et internationalt miljø og har en inkluderende, stimulerende og uformel arbejdskultur. DTU har campusser i hele Danmark og i Grønland og samarbejder med de bedste universiteter verden over.